LTArcheologiniai tyrinėjimai vienuolyno teritorijoje buvo atliekami 2000, 2002 ir 2004 m. Tuo metu buvo tyrinėjama tik buvusio Paparčių Dominikonų vienuolyno teritorijos V dalis, kurioje stovėjo vienuolyno pastatai. Tyrinėjimų metu buvo nustatytas preliminarus vienuolyno ir bažnyčios planas bei kapinių ribos. Rasti kultūriniai sluoksniai datuojami XVII–XIX a., jų storis yra nuo 60 cm iki 2,5 m (žr. ATL 2000 metais, Vilnius, 2002, p. 153–155; ATL 2002 metais, Vilnius, 2005, p. 173–179; ATL 2004 metais, Vilnius, 2006, p. 185–187). Rytinėje, ūkinėje vienuolyno dalyje archeologiniai tyrinėjimai iki šiol nebuvo atliekami. Tyrinėtoje numatomo statyti priestato vietoje susiklostė nuo 70 cm iki 1,12 m storio kultūrinių sluoksnių klodas. Keturiose iš 6 perkasų virš geologinių sluoksnių užfiksuotas apie 10 cm storio pilko juodžemio sluoksnis. Tai gali būti tiek miško dirvožemis, tiek buvusių vienuolyno daržų ar sodo žemė. Tiksliau apibūdinti sluoksnio susidarymo aplinkybių negalima, nes juodžemio sluoksnyje nerasta jokių archeologinių radinių. Sluoksnyje rastos kelios smulkios virimo puodų ir balto fajanso lėkščių šukės, datuojamos ne anksčiau kaip XIX a. [...] [p. 337-339].
ENIn 2011, six trenches (a total of 22 m2) were excavated on the grounds of the Paparčiai (Central Lithuania) Dominican monastery complex. A 70–112 cm thick cultural layer, created during the 17th–19th centuries at the site of the monastery’s garden or orchard, was found at the excavated sites. No traces of former structures were found, only the rubble from the monastery buildings demolished in the late 19th century that had been dumped there.